La hacienda de Chichimequillas se localiza en el municipio El Marqués, Querétaro. Fue construida hacia el año 1690, por los monjes carmelitas que se establecieron en la zona, para asentar y asistir a los indígenas chichimecas jonaces y pames, y a la vez ofrecer albergue a los viajeros que recorrían el Camino Real de Tierra Adentro hacia y desde las zonas mineras de Guanajuato y Zacatecas.

La ex hacienda Ciénaga de Mata se ubica en la localidad de Francisco Primo de Verdad, municipio de Lagos de Moreno, Jalisco. Antiguamente se le conocía como Ciénaga de Rincón, gracias al prestigio logrado por el mayorazgo Rincón Gallardo, también marqueses de Guadalupe. La cercanía de esta área con Zacatecas y otros centros mineros necesitados de granos y carne, fue un aliciente para que los primeros hombres poseedores de títulos y tierra se interesaran en hacer productiva la zona, a pesar de su hostilidad.

Los orígenes de la hacienda de San José de Cieneguilla, en el estado de Aguascalientes, se remontan a 1616 cuando el matrimonio formado por Vicente de Zaldívar y Mendoza y Ana Bañuelos adquirieron las tierras, para posteriormente donar la propiedad a la Compañía de Jesús de Zacatecas para el sostenimiento del colegio de San Luis que se encuentra en ese lugar. La donación incluía los terrenos y sus construcciones, mulas, burros, caballos, yeguas, carretas, herramientas, aperos, sementeras de maíz y semillas frutales, el trabajo de herraderos y servicio de indios.

La Hacienda de la Limpia Concepción de El Canutillo, ubicada en el actual municipio de Ocampo, en Durango, data de la segunda mitad del siglo XVII y fue edificada originalmente cono estancia agrícola, cuya función era abastecer al centro minero de Parral (Chihuahua). Sin embargo, llegó a convertirse en una de las haciendas más ricas de la región, ya que su cercanía al Río Florido favorecía la irrigación de la tierra y por lo tanto la productividad.

La hacienda Pabellón de Hidalgo, al igual que la mayoría de las que existen en Aguascalientes, es resultado de la participación de los mineros de Zacatecas en la inversión variada. Los sitios de Garabato y San Isidro, adquiridos por el minero zacatecano José de la Peña Durán en 1681, darían origen a la hacienda de Pabellón de Hidalgo.

La hacienda de Peñuelas fue fundada en 1612, lo que la convierte en una de las más antiguas de Aguascalientes. Originalmente se estableció con el nombre de San Isidro Labrador, el cual cayó en desuso debido a que la gente tomaba como referencia el paisaje de peñas de la zona, de donde derivó el apelativo que llegó a nuestros días.

Otros de los puntos importantes del itinerario del Camino Real de Tierra Adentro localizado en el actual estado de Durango es la Hacienda de San Diego de Navacoyán, a orillas del río Tunal, el cual era necesario cruzar para seguir la ruta rumbo a Chihuahua y Nuevo México.

La orden franciscana tuvo una prolífera presencia en diversos puntos de la Nueva España y en particular en lo que hoy es el estado de Zacatecas, en cuyas afueras fray Antonio Margil de Jesús, junto con otros diez franciscanos fundó el 12 de enero de 1707 el Colegio de Nuestra Señora de Guadalupe de Propaganda Fide, el cual interactuaba con su similar de Santa Cruz de Querétaro, a lo largo del Camino Real de Tierra Adentro. La construcción se llevó a cabo entre 1713 y 1717 siendo el responsable de la construcción  el padre guardián José Guerra.

Localizado en el municipio de Tepotzotlán, Estado de México, el antiguo Colegio y Seminario conciliar de San Francisco Javier, de la Compañía de Jesús fue por muchas generaciones un sitio de peregrinaje chichimeca hasta que en el siglo XV se fundó formalmente el señorío independiente de Tepotzotlán, en 1460.

Durante la época virreinal, el actual territorio del estado de Hidalgo fue de suma importancia por su actividad misionera, por lo que fueron fundados en la llamada provincia del santo Evangelio diversas iglesia y conventos, los cuales fueron dependientes de la arquidiócesis de México. La amplia actividad misionera dio inicio en el centro prehispánico de Tula, la cual estuvo encabezada por los franciscanos, la primera orden en llegar a la provincia. Así mismo, en el Estado de Hidalgo se dieron los primeros descubrimientos de minas importantes cercanas a la ciudad de México.

El antiguo Hospital de San Juan de Dios de la ciudad de San Miguel de Allende, Guanajuato, conocido también como Hospital Real, obra atribuida al cura Juan Manuel de Villegas, quien estuvo encargado de su construcción en 1753.

Durante el siglo XVI la corona española intentó poblar el territorio de la antigua encomienda de Jilotepec, el cual se ubicaba en la frontera chichimeca, con ello buscaba proteger el camino proveniente de la ciudad de México al septentrión novohispano.