Las salas de este inmueble han tenido diferentes funciones a lo largo del tiempo, y de ello son testigos los vestigios que muestran las ventanas arqueológicas. Ésta muestra un drenaje y muros virreinales.

Entre pisos, muros, cimientos y drenajes, la primera ventana del MNCM muestra el devenir histórico del inmueble que ocupa.

Ubicada en el patio posterior del Ex Convento de Santa Teresa la Antigua, exhibe vestigios arqueológicos de la época virreinal, entre ellos destacan una fuente del siglo XVIII y jardines históricos.

En el Antiguo Palacio de odontología de la UNAM se encuentran los vestigios de seis espacios del convento de Santa Teresa la Antigua, inmueble de los siglos XVII y XVIII donde residía la orden de las Carmelitas Descalzas de San José.

En una de las salas de la que fue la primera casa impresora del continente, utilizada como librería de la Universidad Autónoma Metropolitana (UAM), se exhibe una escultura monumental que representa una cabeza de serpiente.

La primera ventana del Antiguo Palacio del Arzobispado expone piezas prehispánicas y restos arquitectónicos del templo del dios Tezcatlipoca.

Los resultados de las investigaciones proponen que estas ventanas arqueológicas muestran vestigios de la casa de Hernán Cortés.

En el Patio de Maniobras del Palacio Nacional se puede ver una basa cruciforme, arranque de escalinata, piso de estuco y drenajes que probablemente hayan sido del palacio de Moctezuma II.

Esta ventana ubicada en un jardín abierto, muestra vestigios de una escalinata perteneciente a la casa del tlatoani Moctezuma Xocoyotzin.

Antigua residencia virreinal, de los presidentes y de uno de los emperadores, el Castillo de Chapultepec fue importante escenario de la Guerra de 1847 y resguarda una espléndida y nutrida colección sobre la historia nacional.