Museo alojado en una casa habitación del siglo XVIII, uno de los mejores ejemplos de la arquitectura del poblado, donde, en 1794 (cuando Comonfort aún era conocido como Chamacuero), nació José María Luis Mora, distinguido escritor y político liberal que colaboró en la promulgación de las Leyes de Reforma de 1833. El recinto de un solo nivel y de fachada sencilla resguarda un acervo conformado por objetos virreinales (como telares, rueca, cuadros, libros y documentos) y arqueológicos de lítica y cerámica (figurillas antropomorfas, ollas, cajetes policromos y cuchillos de obsidiana). A pesar de que el acuerdo entre la presidencia municipal de Comonfort y el Instituto Nacional de Antropología e Historia se firmó el 5 de marzo de 1979, el museo abrió sus puertas hasta diciembre de 1989.