Este asentamiento mantuvo una posición importante en la región hasta que fue conquistado por los mexicas al mando de Moctezuma Ilhuicamina, en 1465. La zona forma parte de varios sitios que fundaron después del abandono de la ciudad de El Tajín. En el caso de Cuyuxquihui se han identificado estructuras arquitectónicas similares a fortificaciones, por lo que se interpreta que diversos movimientos migratorios fueron acompañados de conflictos bélicos entre determinados grupos.