El teniente Jeremy F. Gilmer estableció el fuerte como la primera instalación del ejército en el suroeste para proteger a los soldados de un posible levantamiento local.

Siguiendo su diseño, se construyeron muros de cinco pies de grosor y nueve pies de alto con una mezcla de tierra, agua y fragmentos de cerámica y piedra. El recinto tenía forma de estrella, con un almacén semi subterráneo para guardar pólvora y una caseta de adobe. Cada ángulo del fuerte tenía el pueblo de Santa Fe a la vista y al alcance de un tiro.

Fort Marcy fue un recordatorio simbólico para los residentes de que las tropas de los Estados Unidos estaban en Nuevo México para quedarse, aunque sus cuarteles nunca fueron ocupados, tan pronto como se construyó, las paredes comenzaron a erosionarse.

Una asociación entre la Ciudad de Santa Fe y el Servicio de Parques Nacionales produjo recientemente una serie de nuevas exhibiciones interpretativas que guían a los visitantes a través del sitio. Aunque la experiencia física del fuerte ahora se deja en gran parte a la imaginación, el punto elevado de observación preserva la experiencia visual de observar el centro de la ciudad desde arriba.