Los primeros vecinos de la península vieron truncados los sueños de riquezas por lo pobre de la tierra y cimentaron sus esperanzas de mejoramiento material en las mercedes que el rey les concediese sobre el trabajo de los naturales de la región. De las ancestrales piedras de la ciudad maya, emergió Mérida.

La orden de San Francisco llegó a Yucatán en 1545 para fundar el Convento Grande de San Francisco, desde donde dominaron por tres siglos la labor evangelizadora. Se destinó la cuadra del sur de la Plaza Principal para casa del conquistador, la norte para el asiento de las Casas Reales, representantes del poder civil de la corona y la oriente para la edificación de la Catedral y la casa del obispo: El Palacio Episcopal.