El recorrido en el segundo piso del museo ilustra algunos de los principales aspectos de la sociedad, la cultura y los hechos políticos y militares que han marcado, después de la Conquista, la vida de Nueva España y México; se destaca especialmente la importancia que tuvo la gente y el territorio del actual del estado de Morelos.

A lo largo de este panorama, que abarca del siglo XVI al XX, los grandes procesos históricos de trasformación del país (el Virreinato, la Independencia, la Reforma, el Porfiriato y la Revolución) se han expresado en Morelos, en sus poblados y con el protagonismo de sus hombres y mujeres. El rostro actual de la entidad se refleja en el estudio de ese pasado.