En 1548, el obispo de Guadalajara construyó un santuario en el Cerro de la Bufa. Para 1728, el conde de Santiago de la Laguna José Rivera de Bernárdez compró el terreno entre los dos crestones y reconstruyó la capilla con advocación a la Virgen de la Purísima Concepción, la cual fue reedificada en 1790 por iniciativa de José Mariano Bezanilla Mier y Campa. En 1810 se contruyó un espacio usado como centro de ejercicios espirituales. Entre 1881 y 1885 el presbítero José Eugenio Nava edificó nuevamente la casa del capellán.

Gracias a su ubicación estratégica, ha sido usado como punto militar. En 1984 se inauguró el museo de la Toma de Zacatecas en el maarco del 70 aniversario de esta batalla.