Antes de 1869, este terreno formaba parte de la huerta Era de Hidalgo. Esta estación perteneció al ramal Apizaco-Puebla de Ferrocarril Mexicano, la cual fue inaugurada el 16 de septiembre de 1869 por el entonces presidente, Benito Juárez; posteriormente fue reinaugurada el 5 de mayo de 1962 por Benjamín Méndez, gerente general de Ferrocarriles Nacionales de México. En 1974 fue retirada del servicio ferroviario y el 5 de mayo de 1988 se inauguró como Museo Nacional de los Ferrocarriles Mexicanos.