El edificio de la Casa del Gobernador y sus espacios interiores fueron la residencia del castellano de la plaza, quien gobernaba la fortaleza.

El espacio de la planta baja se organiza en cuatro bóvedas a prueba de bomba, es decir que resisten el impacto de las balas de cañón, las cuales fueron utilizados como almacenes. Fue recinto presidencial en la época del Primer Jefe de Gobierno, Venustiano Carranza. La fachada fue realizada a principios del siglo XX con un estilo ecléctico.

Actualmente es el museo de sitio de la fortaleza.