El complejo de Calica incluía cenotes de agua dulce y salada. Los mas importantes eran el Kaahú Hum y el Yikliil Cab, en el primero se encuentran alineamientos que se distribuyen formando solares en torno al cenote, además de esto incluye un complejo de plataforma habitacional denominado “Grupo cenote.” Mientras que en el Cenote Yikliil Cab no se construyeron albarradas que lo seccionaran o delimitaran. Esto muestra una forma de controlar el acceso al agua dulce, el primero, posiblemente, destinado a los grupos privilegiados, mientras que el segundo canalizaba aguas para uso común.

El patrón de asentamiento de este sitio se caracteriza por una compleja red de albarradas o muros de piedra caliza acomodada y consolidada en seco que delimitan los solares, algunos incluyen plataformas y estructuras habitacionales sin construcciones. En este territorio las aguadas y las cavernas son muy abundantes, desde simples cuevas hasta sistemas subterráneos de varios kilómetros, dentro de algunas cavernas se construyeron albarradas que delimitaban espacios conformando habitaciones. Asimismo, en algunas cuevas, con mantos de agua dulce, se han encontrado escalinatas construidas para facilitar el acceso al agua.

Este lugar es un ejemplo de la asociación templo-cueva, pues el conjunto denominado Kisim o Grupo de la estela está construido sobre una caverna. Además de ello conserva un edificio estilo Costa oriental, conocido como Templo de las columnas cuyo interior mantiene el santuario denominado La casa azul, éste presenta 26 capas de aplanados de estuco, incluyendo un mural en la fachada que conserva más del 35% de sus pigmentos que muestra elementos de su cosmovisión.