La colección está formada por piezas de cerrajería, implementos de caballería y otros objetos de uso diverso. Realizados en hierro forjado, casi siempre cincelado y calado, se conservan chapas, llaves, estribos, baúles y espuelas. Es importante destacar los elementos de hierro integrados al edificio, como la cruz afiligranada y el barandal de la torre de la iglesia de San Francisco Javier.
Las armas de fuego y armaduras constituyen una de las colecciones más extensas de su tipo en México. Algunas piezas fueron elaboradas durante los 300 años del periodo virreinal, otras fueron traídas de Europa. Destacan las armas de fuego con culatas e incrustaciones de hueso y marfil, espadas de los siglos XVI y XVII, armaduras de torneo y piezas sueltas como yelmos, cascos y corazas.