Integrada por 350 colonias representadas por 43 especies silvestres, de las cuales seis se encuentran en alguna categoría de riesgo, de la NOM-056-2010 de la SEMARNAT. Los ejemplares se encuentran distribuidos en un espacio específico y sobre los árboles del Jardín. Se realiza actividades para su recuperación, conservación y propagación de las plantas. La mayoría de las orquídeas tiene uso ornamental. Por otro lado, existen especies registradas en códices del siglo XVI, donde se menciona su uso ceremonial, medicinal, o como pegamento y saborizante.