El museo es pequeño, de una sola planta y su exhibición está dedicada a la prehistoria de México, los temas que trata son los siguientes: Tabla geológica del tiempo, Genealogía del ser humano, Pleistoceno, Corrientes Migratorias, Situación geográfica de la cuenca de México, Flora y Fauna de la época, Primeros pobladores, Artefactos líticos, Quehacer del investigador y Métodos de datación.