El periodo Preclásico fue una época de formación de los elementos que constituyen lo que conocemos como Mesoamérica. En Tlapacoya se encontraron las primeras evidencias de pirámides con cuerpos escalonados del Preclásico tardío. Ahí se exploraron tres tumbas cubiertas por lajas basálticas acompañadas de una gran cantidad de cerámica de formas muy especiales: siluetas compuestas, grandes vasos con soportes, botellones, copas y cajetes, de color negro o café oscuro con un gran lustre. Este tipo de cerámica no aparece en ningún otro sitio, por lo que seguramente fue elaborada con fines rituales.