Desde hace más de dos décadas, la arqueóloga del Centro INAH Aguascalientes, Ana María Pelz Marín, ha realizado varias investigaciones que han dado como fruto hallazgos arqueológicos en el estado. Esto ha detonado nuevas hipótesis sobre los antiguos pobladores de la región; parte de los nuevos hallazgos ahora forman parte de esta colección. Asimismo, personas de la comunidad, interesadas en conservar y promover el patrimonio arqueológico, han donado sus colecciones al Museo.