Cerca de 1521 el Rey Francisco I de Francia planeaba invadir Navarra y el duque de Nájera entonces virrey de Navarra, solicitó a Ignacio que fuera a Loyola, reclutará soldados, hiciera acopio de armamento y acudiera a la defensa de la fortaleza de Pamplona. Los franceses asediaron la ciudad y se apoderaron de ella. En la defensa, San Ignacio salió malherido de una pierna.