Fray José Guerra nació en la hacienda de San Nicolás de los Andas en la Villa de Santa María de los Lagos, en el Reino de Nueva Galicia. Tomó el hábito franciscano en el convento de San Cosme de la ciudad de México. En 1702 viajó con otros frailes del Colegio de la Santa Cruz de Querétaro al Santuario dedicado a la Virgen de Guadalupe en Zacatecas, para convertirlo en un Hospicio de misioneros; desde entonces se convirtió en su Presidente y fundador. Guerra recabó fondos entre benefactores que donaron tierras y recursos para su construcción. El Colegio Apostólico comenzó a funcionar en 1707 con el franciscano como su primer Guardián.  Sostuvo una estrecha amistad con fray Antonio Margil quien solía decir “que el padre Guerra era verdadera guerra para el Infierno”. El fraile murió a los 63 años en la ciudad de Zacatecas.