La muestra estuvo conformada por 750 elementos arqueológicos procedentes del acervo que reunió la investigadora Emilia Florencia Jacobs Baquero (1903-1984), y hoy bajo el resguardo de dicho centro de investigación. La sede de esta exposición fue el propio Departamento.

Resumen: El Departamento de Colecciones Arqueológicas Comparativas se creó en 1995, y alberga materiales que van del periodo Preclásico (2500 a.C.-200 d.C.) a la época decimonónica, recuperados por pioneros de la arqueología en México, como Florencia Müller y Beatriz Braniff. Los objetos arqueológicos proceden de 170 sitios investigados sistemáticamente, principalmente vinculados con la Cuenca de México.