Desde el siglo pasado, los investigadores notaron que alrededor de los grandes templos y plazas se localizaban numerosos conjuntos de edificios más pequeños, en los cuales se han localizado entierros humanos y objetos relacionados con la preparación y consumo de alimentos, la producción de artefactos de obsidiana y pedernal, así como objetos y espacios arquitectónicos de carácter ritual que nos hablan de las creencias e ideología de los grupos familiares que ahí habitaron. En Palenque se han excavado cinco unidades habitacionales, cuatro de ellas pueden visitarse a través de un sendero ecológico y arqueológico.
INAH-Museo de Sitio de Palenque "Alberto Ruz L'Huillier"
Se ubica en el sendero ecológico-arqueológico. Está conformado por una gran cantidad de edificios, distribuidos entre los arroyos Otulúm y Murciélagos, que fueron levantados sobre basamentos bajos, con una y hasta cuatro crujías paralelas. Estos edificios presentan múltiples subdivisiones que indican posibles habitaciones para la actividad cotidiana; tienen uno o dos niveles comunicados por escaleras interiores angostas. Algunos de los aposentos contienen una tumba bajo el piso; otros, como el Edificio 3, albergan una pequeña cámara funeraria. Actualmente se encuentran explorados los edificios 1, 2 y una pequeña esquina del 3.
INAH-Museo de Sitio de Palenque "Alberto Ruz L'Huillier"
Conjunto de edificios construidos sobre una ladera modificada, de roca caliza, que se ajusta a las variaciones del terreno. Los edificios se encuentran limitados por terrazas y patios que presentan generalmente accesos, escaleras y corredores angostos. Poseen una antecámara cerrada por una bóveda que conduce al nivel superior. Los grupos I y II están contiguos, y forman en conjunto el Grupo I, que se integra con los edificios 1, 2 y 3, que en realidad son tres desniveles, de los que el 3 es el nivel más bajo; entre el 2 y el 3 existe una especie de explanada en forma de L. El Grupo II lo conforman las estructuras 11, 12, 13, 15 y 16, que dan hacia un patio central.
INAH-Museo de Sitio de Palenque "Alberto Ruz L'Huillier"
Este grupo junto con los conjuntos I, II, y C forman parte del corredor turístico que se ha denominado “sendero eco-arqueológico”, en este, el visitante recorre estos conjuntos arquitectónicos de tipo habitacional, con espacios dedicados al culto, en medio de una densa capa vegetal. Este grupo se localiza al noreste de la Gran Plaza y se integra por 5 estructuras alargadas (o de planta rectangular), distribuidas alrededor de un patio central: al oeste se localizan los edificios 1, 4 y 5 y al este los edificios 2 y 3.
Este grupo se emplaza sobre una terraza entre los ríos Otulúm y Murciélagos (este y oeste respectivamente), y al pie de dos caídas de agua una de las cuales es conocida como El Baño de la Reina. La función de estos edificios era de carácter habitacional y en la mayoría de ellos se encontraron tumbas funerarias, destacando el hallazgo de entierros humanos con figurillas modeladas como ofrendas. La ocupación es predominantemente tardía, entre 770 y 850.
INAH-Museo de Sitio de Palenque "Alberto Ruz L'Huillier"
Este grupo se ubica en la sección este de Palenque, estratégicamente asentado sobre los filos de la montaña. Se conforma de varias plazas y edificios a distintos niveles, los cuales fueron construidos aprovechando la topografía del terreno. Los edificios de carácter habitacional, presentan una planta de forma rectangular, pasillos angostos y algunos de ellos conservan todavía sus bóvedas. Durante las excavaciones se localizaron varios entierros humanos, abundante material cerámico y lítico. Este conjunto ha sido fechado para el año 750-850. El antiguo acceso a este grupo se halla hacia el oeste a través de un puente hecho en mampostería de piedra caliza, mismo que cruza el arroyo Murciélagos. Los edificios que componen el conjunto rodean una plaza central: los edificios C1 y C2 al sur, C3, C4 y C5 al este y por último los edificios C6, C7 y C8 al oeste.
